โรงเรียนบ้านในเหมือง  เดิมชื่อว่า  โรงเรียนประชาบาล  ตำบลนาขา  3  (บ้านในหูต)   นายเนิ่น   ศรีเวชนันท์   อดีตอาจารย์ใหญ่  ได้ขออนุญาตเปลี่่ยนชื่อใหม่เป็น โรงเรียนบ้านในเหมือง

โรงเรียนนี้ก่อตั้งเมื่อ  8  กรกฎาคม  2479  โดยอาศัยโรงมหรสพในที่ดินเหมืองแร่บริษัท  เพนนินซูลาติน   สมัยหลวงปราณีประชาชน   เป็นนายอำเภอหลังสวน   มีนายใย  มัยโภคาเป็นครูใหญ่  ต่อมา

ได้จัดสร้างอาคารเรียนชั่วคราว  1  หลังขึ้นในเนื้อที่  18  ไร่  ซึ่งเป็นที่ดินของโรงเรียนในปัจจุบัน   เปิดเรียนเมื่อ  มกราคม  2480   และได้รับงบประมาณ  40,000   บาท   สร้างอาคารเรียนแบบ

002   จำนวน  1  หลัง  3  ห้องเรียน  สร้างเสร็จเข้าเรียนได้วันที่  6  พฤษภาคม  2501เปิดสอนตั้งแต่   ป.1-ป. 4   และเปิดเรียนชั้น  ป.5   เมื่อ  1  พฤษภาคม  2508  มีนักเรียน  26  คน ต่อมา

เมื่อ   พ.ศ.  2520   ได้ใบมอบที่ดินจาก   บริษัท  เหมืองแร่ชุมพร  จำกัด   อีกจำนวน  10  ไร่